Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8N6

Aknad1, AKNA domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aknad1E9Q8N6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Aknad1E9Q8N6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Aknad1E9Q8N6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Aknad1E9Q8N6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Aknad1E9Q8N6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Aknad1E9Q8N6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Aknad1E9Q8N6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Aknad1E9Q8N6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Aknad1E9Q8N6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Aknad1E9Q8N6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Aknad1E9Q8N6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Aknad1E9Q8N6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Aknad1E9Q8N6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Aknad1E9Q8N6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Aknad1E9Q8N6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Aknad1E9Q8N6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Aknad1E9Q8N6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Aknad1E9Q8N6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Aknad1E9Q8N6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Aknad1E9Q8N6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Aknad1E9Q8N6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Aknad1E9Q8N6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Aknad1E9Q8N6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Aknad1E9Q8N6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Aknad1E9Q8N6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Aknad1E9Q8N6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Aknad1E9Q8N6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Aknad1E9Q8N6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Aknad1E9Q8N6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Aknad1E9Q8N6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Aknad1E9Q8N6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Aknad1E9Q8N6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Aknad1E9Q8N6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Aknad1E9Q8N6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Aknad1E9Q8N6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Aknad1E9Q8N6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Aknad1E9Q8N6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Aknad1E9Q8N6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Aknad1E9Q8N6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Aknad1E9Q8N6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Aknad1E9Q8N6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Aknad1E9Q8N6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Aknad1E9Q8N6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Aknad1E9Q8N6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Aknad1E9Q8N6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Aknad1E9Q8N6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Aknad1E9Q8N6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Aknad1E9Q8N6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Aknad1E9Q8N6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Aknad1E9Q8N6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Aknad1E9Q8N6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Aknad1E9Q8N6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Aknad1E9Q8N6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Aknad1E9Q8N6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Aknad1E9Q8N6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Aknad1E9Q8N6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Aknad1E9Q8N6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Aknad1E9Q8N6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Aknad1E9Q8N6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Aknad1E9Q8N6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Aknad1E9Q8N6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Aknad1E9Q8N6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Aknad1E9Q8N6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Aknad1E9Q8N6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Aknad1E9Q8N6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Aknad1E9Q8N6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Aknad1E9Q8N6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Aknad1E9Q8N6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Aknad1E9Q8N6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Aknad1E9Q8N6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Aknad1E9Q8N6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Aknad1E9Q8N6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Aknad1E9Q8N6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Aknad1E9Q8N6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Aknad1E9Q8N6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Aknad1E9Q8N6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Aknad1E9Q8N6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Aknad1E9Q8N6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Aknad1E9Q8N6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Aknad1E9Q8N6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Aknad1E9Q8N6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Aknad1E9Q8N6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Aknad1E9Q8N6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Aknad1E9Q8N6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Aknad1E9Q8N6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Aknad1E9Q8N6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Aknad1E9Q8N6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Aknad1E9Q8N6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Aknad1E9Q8N6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Aknad1E9Q8N6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Aknad1E9Q8N6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Aknad1E9Q8N6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Aknad1E9Q8N6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Aknad1E9Q8N6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Aknad1E9Q8N6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Aknad1E9Q8N6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Aknad1E9Q8N6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Aknad1E9Q8N6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Aknad1E9Q8N6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Aknad1E9Q8N6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms