Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3G8

Nup153, Nucleoporin 153, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup153E9Q3G8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Nup153E9Q3G8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Nup153E9Q3G8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Nup153E9Q3G8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nup153E9Q3G8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nup153E9Q3G8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nup153E9Q3G8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nup153E9Q3G8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Nup153E9Q3G8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nup153E9Q3G8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nup153E9Q3G8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nup153E9Q3G8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nup153E9Q3G8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nup153E9Q3G8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nup153E9Q3G8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nup153E9Q3G8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Nup153E9Q3G8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nup153E9Q3G8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nup153E9Q3G8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nup153E9Q3G8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nup153E9Q3G8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Nup153E9Q3G8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Nup153E9Q3G8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Nup153E9Q3G8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Nup153E9Q3G8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Nup153E9Q3G8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Nup153E9Q3G8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nup153E9Q3G8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nup153E9Q3G8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nup153E9Q3G8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nup153E9Q3G8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Nup153E9Q3G8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Nup153E9Q3G8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Nup153E9Q3G8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Nup153E9Q3G8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Nup153E9Q3G8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Nup153E9Q3G8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Nup153E9Q3G8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Nup153E9Q3G8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nup153E9Q3G8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nup153E9Q3G8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Nup153E9Q3G8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Nup153E9Q3G8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Nup153E9Q3G8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Nup153E9Q3G8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Nup153E9Q3G8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Nup153E9Q3G8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Nup153E9Q3G8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Nup153E9Q3G8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Nup153E9Q3G8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Nup153E9Q3G8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Nup153E9Q3G8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Nup153E9Q3G8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Nup153E9Q3G8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Nup153E9Q3G8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Nup153E9Q3G8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Nup153E9Q3G8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Nup153E9Q3G8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nup153E9Q3G8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nup153E9Q3G8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nup153E9Q3G8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nup153E9Q3G8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Nup153E9Q3G8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Nup153E9Q3G8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Nup153E9Q3G8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Nup153E9Q3G8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Nup153E9Q3G8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Nup153E9Q3G8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Nup153E9Q3G8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Nup153E9Q3G8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Nup153E9Q3G8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Nup153E9Q3G8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nup153E9Q3G8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nup153E9Q3G8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nup153E9Q3G8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Nup153E9Q3G8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nup153E9Q3G8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nup153E9Q3G8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Nup153E9Q3G8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nup153E9Q3G8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nup153E9Q3G8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nup153E9Q3G8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nup153E9Q3G8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nup153E9Q3G8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nup153E9Q3G8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nup153E9Q3G8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Nup153E9Q3G8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Nup153E9Q3G8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Nup153E9Q3G8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Nup153E9Q3G8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nup153E9Q3G8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nup153E9Q3G8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nup153E9Q3G8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nup153E9Q3G8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nup153E9Q3G8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nup153E9Q3G8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nup153E9Q3G8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Nup153E9Q3G8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nup153E9Q3G8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nup153E9Q3G8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms