Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Tarbp1E9Q368 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Tarbp1E9Q368 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Tarbp1E9Q368 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Tarbp1E9Q368 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Tarbp1E9Q368 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Tarbp1E9Q368 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Tarbp1E9Q368 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Tarbp1E9Q368 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Tarbp1E9Q368 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Tarbp1E9Q368 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Tarbp1E9Q368 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Tarbp1E9Q368 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Tarbp1E9Q368 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Tarbp1E9Q368 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Tarbp1E9Q368 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Tarbp1E9Q368 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Tarbp1E9Q368 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Tarbp1E9Q368 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
Tarbp1E9Q368 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Tarbp1E9Q368 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Tarbp1E9Q368 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Tarbp1E9Q368 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Tarbp1E9Q368 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Tarbp1E9Q368 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Tarbp1E9Q368 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Tarbp1E9Q368 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Tarbp1E9Q368 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Tarbp1E9Q368 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Tarbp1E9Q368 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Tarbp1E9Q368 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Tarbp1E9Q368 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.65
Tarbp1E9Q368 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Tarbp1E9Q368 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Tarbp1E9Q368 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Tarbp1E9Q368 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
Tarbp1E9Q368 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
Tarbp1E9Q368 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Tarbp1E9Q368 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Tarbp1E9Q368 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Tarbp1E9Q368 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Tarbp1E9Q368 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Tarbp1E9Q368 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Tarbp1E9Q368 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Tarbp1E9Q368 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Tarbp1E9Q368 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Tarbp1E9Q368 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Tarbp1E9Q368 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Tarbp1E9Q368 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Tarbp1E9Q368 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Tarbp1E9Q368 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Tarbp1E9Q368 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Tarbp1E9Q368 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
Tarbp1E9Q368 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Tarbp1E9Q368 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Tarbp1E9Q368 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
Tarbp1E9Q368 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Tarbp1E9Q368 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Tarbp1E9Q368 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Tarbp1E9Q368 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Tarbp1E9Q368 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Tarbp1E9Q368 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Tarbp1E9Q368 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Tarbp1E9Q368 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Tarbp1E9Q368 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Tarbp1E9Q368 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Tarbp1E9Q368 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Tarbp1E9Q368 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Tarbp1E9Q368 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Tarbp1E9Q368 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Tarbp1E9Q368 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Tarbp1E9Q368 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
Tarbp1E9Q368 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Tarbp1E9Q368 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
Tarbp1E9Q368 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Tarbp1E9Q368 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Tarbp1E9Q368 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Tarbp1E9Q368 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
Tarbp1E9Q368 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Tarbp1E9Q368 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Tarbp1E9Q368 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Tarbp1E9Q368 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Tarbp1E9Q368 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Tarbp1E9Q368 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Tarbp1E9Q368 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Tarbp1E9Q368 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Tarbp1E9Q368 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Tarbp1E9Q368 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Tarbp1E9Q368 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Tarbp1E9Q368 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Tarbp1E9Q368 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Tarbp1E9Q368 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Tarbp1E9Q368 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Tarbp1E9Q368 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Tarbp1E9Q368 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Tarbp1E9Q368 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Tarbp1E9Q368 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Tarbp1E9Q368 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Tarbp1E9Q368 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Tarbp1E9Q368 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms