Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdzd2E9Q1M1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdzd2E9Q1M1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdzd2E9Q1M1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdzd2E9Q1M1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdzd2E9Q1M1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdzd2E9Q1M1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdzd2E9Q1M1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd2E9Q1M1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd2E9Q1M1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd2E9Q1M1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd2E9Q1M1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd2E9Q1M1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd2E9Q1M1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd2E9Q1M1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdzd2E9Q1M1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdzd2E9Q1M1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pdzd2E9Q1M1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pdzd2E9Q1M1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pdzd2E9Q1M1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Pdzd2E9Q1M1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Pdzd2E9Q1M1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pdzd2E9Q1M1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzd2E9Q1M1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzd2E9Q1M1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzd2E9Q1M1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzd2E9Q1M1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzd2E9Q1M1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzd2E9Q1M1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzd2E9Q1M1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzd2E9Q1M1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzd2E9Q1M1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzd2E9Q1M1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzd2E9Q1M1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzd2E9Q1M1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzd2E9Q1M1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzd2E9Q1M1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzd2E9Q1M1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzd2E9Q1M1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzd2E9Q1M1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzd2E9Q1M1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzd2E9Q1M1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzd2E9Q1M1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdzd2E9Q1M1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdzd2E9Q1M1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdzd2E9Q1M1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdzd2E9Q1M1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzd2E9Q1M1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzd2E9Q1M1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzd2E9Q1M1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdzd2E9Q1M1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdzd2E9Q1M1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdzd2E9Q1M1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdzd2E9Q1M1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdzd2E9Q1M1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdzd2E9Q1M1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdzd2E9Q1M1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdzd2E9Q1M1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdzd2E9Q1M1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pdzd2E9Q1M1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pdzd2E9Q1M1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pdzd2E9Q1M1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pdzd2E9Q1M1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pdzd2E9Q1M1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pdzd2E9Q1M1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pdzd2E9Q1M1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Pdzd2E9Q1M1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pdzd2E9Q1M1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pdzd2E9Q1M1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pdzd2E9Q1M1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pdzd2E9Q1M1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pdzd2E9Q1M1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pdzd2E9Q1M1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pdzd2E9Q1M1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdzd2E9Q1M1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdzd2E9Q1M1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdzd2E9Q1M1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdzd2E9Q1M1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdzd2E9Q1M1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdzd2E9Q1M1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdzd2E9Q1M1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdzd2E9Q1M1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pdzd2E9Q1M1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pdzd2E9Q1M1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pdzd2E9Q1M1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pdzd2E9Q1M1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pdzd2E9Q1M1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pdzd2E9Q1M1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pdzd2E9Q1M1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pdzd2E9Q1M1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pdzd2E9Q1M1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pdzd2E9Q1M1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pdzd2E9Q1M1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pdzd2E9Q1M1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pdzd2E9Q1M1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pdzd2E9Q1M1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pdzd2E9Q1M1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pdzd2E9Q1M1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pdzd2E9Q1M1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pdzd2E9Q1M1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
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