Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL5

Prrt2, Proline-rich transmembrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt2E9PUL5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Prrt2E9PUL5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Prrt2E9PUL5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Prrt2E9PUL5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Prrt2E9PUL5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Prrt2E9PUL5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Prrt2E9PUL5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Prrt2E9PUL5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Prrt2E9PUL5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Prrt2E9PUL5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Prrt2E9PUL5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Prrt2E9PUL5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Prrt2E9PUL5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Prrt2E9PUL5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Prrt2E9PUL5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Prrt2E9PUL5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Prrt2E9PUL5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Prrt2E9PUL5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Prrt2E9PUL5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Prrt2E9PUL5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Prrt2E9PUL5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Prrt2E9PUL5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Prrt2E9PUL5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Prrt2E9PUL5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Prrt2E9PUL5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Prrt2E9PUL5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Prrt2E9PUL5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Prrt2E9PUL5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Prrt2E9PUL5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Prrt2E9PUL5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Prrt2E9PUL5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Prrt2E9PUL5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Prrt2E9PUL5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Prrt2E9PUL5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Prrt2E9PUL5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Prrt2E9PUL5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Prrt2E9PUL5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Prrt2E9PUL5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Prrt2E9PUL5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Prrt2E9PUL5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Prrt2E9PUL5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Prrt2E9PUL5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Prrt2E9PUL5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Prrt2E9PUL5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Prrt2E9PUL5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Prrt2E9PUL5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Prrt2E9PUL5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Prrt2E9PUL5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Prrt2E9PUL5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Prrt2E9PUL5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Prrt2E9PUL5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Prrt2E9PUL5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Prrt2E9PUL5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Prrt2E9PUL5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Prrt2E9PUL5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Prrt2E9PUL5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Prrt2E9PUL5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Prrt2E9PUL5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Prrt2E9PUL5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Prrt2E9PUL5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Prrt2E9PUL5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Prrt2E9PUL5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Prrt2E9PUL5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Prrt2E9PUL5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Prrt2E9PUL5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Prrt2E9PUL5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Prrt2E9PUL5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Prrt2E9PUL5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prrt2E9PUL5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prrt2E9PUL5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prrt2E9PUL5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prrt2E9PUL5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prrt2E9PUL5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prrt2E9PUL5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prrt2E9PUL5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prrt2E9PUL5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Prrt2E9PUL5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prrt2E9PUL5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prrt2E9PUL5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prrt2E9PUL5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Prrt2E9PUL5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Prrt2E9PUL5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Prrt2E9PUL5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prrt2E9PUL5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Prrt2E9PUL5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prrt2E9PUL5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Prrt2E9PUL5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prrt2E9PUL5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prrt2E9PUL5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prrt2E9PUL5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prrt2E9PUL5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prrt2E9PUL5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prrt2E9PUL5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prrt2E9PUL5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prrt2E9PUL5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prrt2E9PUL5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prrt2E9PUL5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prrt2E9PUL5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prrt2E9PUL5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prrt2E9PUL5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms