Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Klhl3E0CZ16 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klhl3E0CZ16 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Klhl3E0CZ16 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Klhl3E0CZ16 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Klhl3E0CZ16 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhl3E0CZ16 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhl3E0CZ16 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhl3E0CZ16 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhl3E0CZ16 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl3E0CZ16 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl3E0CZ16 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl3E0CZ16 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl3E0CZ16 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl3E0CZ16 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl3E0CZ16 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhl3E0CZ16 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhl3E0CZ16 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhl3E0CZ16 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhl3E0CZ16 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhl3E0CZ16 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhl3E0CZ16 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhl3E0CZ16 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhl3E0CZ16 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhl3E0CZ16 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhl3E0CZ16 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhl3E0CZ16 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhl3E0CZ16 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhl3E0CZ16 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhl3E0CZ16 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhl3E0CZ16 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhl3E0CZ16 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhl3E0CZ16 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhl3E0CZ16 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhl3E0CZ16 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhl3E0CZ16 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhl3E0CZ16 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhl3E0CZ16 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhl3E0CZ16 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhl3E0CZ16 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhl3E0CZ16 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klhl3E0CZ16 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klhl3E0CZ16 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klhl3E0CZ16 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klhl3E0CZ16 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klhl3E0CZ16 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhl3E0CZ16 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhl3E0CZ16 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhl3E0CZ16 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhl3E0CZ16 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhl3E0CZ16 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhl3E0CZ16 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klhl3E0CZ16 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klhl3E0CZ16 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klhl3E0CZ16 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Klhl3E0CZ16 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klhl3E0CZ16 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhl3E0CZ16 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhl3E0CZ16 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhl3E0CZ16 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhl3E0CZ16 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhl3E0CZ16 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhl3E0CZ16 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl3E0CZ16 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl3E0CZ16 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl3E0CZ16 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl3E0CZ16 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl3E0CZ16 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl3E0CZ16 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl3E0CZ16 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl3E0CZ16 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl3E0CZ16 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl3E0CZ16 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl3E0CZ16 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhl3E0CZ16 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhl3E0CZ16 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhl3E0CZ16 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhl3E0CZ16 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhl3E0CZ16 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhl3E0CZ16 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klhl3E0CZ16 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klhl3E0CZ16 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klhl3E0CZ16 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klhl3E0CZ16 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klhl3E0CZ16 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klhl3E0CZ16 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klhl3E0CZ16 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klhl3E0CZ16 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klhl3E0CZ16 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klhl3E0CZ16 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Klhl3E0CZ16 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Klhl3E0CZ16 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Klhl3E0CZ16 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Klhl3E0CZ16 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Klhl3E0CZ16 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhl3E0CZ16 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhl3E0CZ16 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhl3E0CZ16 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhl3E0CZ16 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klhl3E0CZ16 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms