Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Samd1D3YXK1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Samd1D3YXK1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Samd1D3YXK1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Samd1D3YXK1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Samd1D3YXK1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Samd1D3YXK1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Samd1D3YXK1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Samd1D3YXK1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Samd1D3YXK1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Samd1D3YXK1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Samd1D3YXK1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Samd1D3YXK1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Samd1D3YXK1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Samd1D3YXK1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Samd1D3YXK1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Samd1D3YXK1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Samd1D3YXK1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Samd1D3YXK1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Samd1D3YXK1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Samd1D3YXK1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Samd1D3YXK1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Samd1D3YXK1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Samd1D3YXK1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Samd1D3YXK1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Samd1D3YXK1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Samd1D3YXK1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Samd1D3YXK1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Samd1D3YXK1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Samd1D3YXK1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Samd1D3YXK1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Samd1D3YXK1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Samd1D3YXK1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Samd1D3YXK1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Samd1D3YXK1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Samd1D3YXK1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Samd1D3YXK1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Samd1D3YXK1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Samd1D3YXK1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Samd1D3YXK1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Samd1D3YXK1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Samd1D3YXK1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Samd1D3YXK1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Samd1D3YXK1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Samd1D3YXK1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Samd1D3YXK1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Samd1D3YXK1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Samd1D3YXK1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Samd1D3YXK1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Samd1D3YXK1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Samd1D3YXK1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Samd1D3YXK1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Samd1D3YXK1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Samd1D3YXK1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Samd1D3YXK1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Samd1D3YXK1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Samd1D3YXK1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Samd1D3YXK1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Samd1D3YXK1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Samd1D3YXK1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Samd1D3YXK1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Samd1D3YXK1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Samd1D3YXK1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Samd1D3YXK1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Samd1D3YXK1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Samd1D3YXK1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Samd1D3YXK1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Samd1D3YXK1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Samd1D3YXK1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Samd1D3YXK1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Samd1D3YXK1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Samd1D3YXK1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Samd1D3YXK1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Samd1D3YXK1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Samd1D3YXK1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Samd1D3YXK1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Samd1D3YXK1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Samd1D3YXK1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Samd1D3YXK1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Samd1D3YXK1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Samd1D3YXK1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Samd1D3YXK1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Samd1D3YXK1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Samd1D3YXK1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Samd1D3YXK1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Samd1D3YXK1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Samd1D3YXK1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Samd1D3YXK1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Samd1D3YXK1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Samd1D3YXK1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Samd1D3YXK1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Samd1D3YXK1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Samd1D3YXK1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Samd1D3YXK1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Samd1D3YXK1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Samd1D3YXK1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Samd1D3YXK1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Samd1D3YXK1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Samd1D3YXK1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Samd1D3YXK1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms