Protein–RNA interactions for Protein: B7XG49

Fam71a, Family with sequence similarity 71, member A, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71aB7XG49 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam71aB7XG49 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam71aB7XG49 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam71aB7XG49 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam71aB7XG49 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam71aB7XG49 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam71aB7XG49 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam71aB7XG49 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam71aB7XG49 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam71aB7XG49 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam71aB7XG49 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam71aB7XG49 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam71aB7XG49 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam71aB7XG49 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam71aB7XG49 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam71aB7XG49 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam71aB7XG49 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam71aB7XG49 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam71aB7XG49 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam71aB7XG49 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam71aB7XG49 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam71aB7XG49 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam71aB7XG49 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam71aB7XG49 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam71aB7XG49 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam71aB7XG49 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam71aB7XG49 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam71aB7XG49 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam71aB7XG49 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam71aB7XG49 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam71aB7XG49 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam71aB7XG49 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam71aB7XG49 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam71aB7XG49 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam71aB7XG49 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam71aB7XG49 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam71aB7XG49 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam71aB7XG49 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam71aB7XG49 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam71aB7XG49 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam71aB7XG49 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam71aB7XG49 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam71aB7XG49 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam71aB7XG49 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam71aB7XG49 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam71aB7XG49 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam71aB7XG49 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam71aB7XG49 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam71aB7XG49 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam71aB7XG49 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam71aB7XG49 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam71aB7XG49 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam71aB7XG49 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam71aB7XG49 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam71aB7XG49 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam71aB7XG49 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam71aB7XG49 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam71aB7XG49 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam71aB7XG49 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam71aB7XG49 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam71aB7XG49 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam71aB7XG49 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam71aB7XG49 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam71aB7XG49 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam71aB7XG49 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam71aB7XG49 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam71aB7XG49 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam71aB7XG49 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam71aB7XG49 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam71aB7XG49 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam71aB7XG49 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam71aB7XG49 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam71aB7XG49 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam71aB7XG49 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam71aB7XG49 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam71aB7XG49 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam71aB7XG49 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam71aB7XG49 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam71aB7XG49 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam71aB7XG49 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam71aB7XG49 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam71aB7XG49 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam71aB7XG49 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam71aB7XG49 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam71aB7XG49 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam71aB7XG49 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam71aB7XG49 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fam71aB7XG49 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam71aB7XG49 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam71aB7XG49 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam71aB7XG49 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam71aB7XG49 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam71aB7XG49 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam71aB7XG49 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam71aB7XG49 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam71aB7XG49 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam71aB7XG49 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam71aB7XG49 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam71aB7XG49 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam71aB7XG49 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms