Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cspp1B2RX88 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cspp1B2RX88 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cspp1B2RX88 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cspp1B2RX88 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cspp1B2RX88 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cspp1B2RX88 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cspp1B2RX88 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cspp1B2RX88 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cspp1B2RX88 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cspp1B2RX88 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cspp1B2RX88 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cspp1B2RX88 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cspp1B2RX88 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cspp1B2RX88 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cspp1B2RX88 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cspp1B2RX88 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cspp1B2RX88 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cspp1B2RX88 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cspp1B2RX88 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cspp1B2RX88 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cspp1B2RX88 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cspp1B2RX88 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cspp1B2RX88 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cspp1B2RX88 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cspp1B2RX88 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Cspp1B2RX88 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cspp1B2RX88 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cspp1B2RX88 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Cspp1B2RX88 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cspp1B2RX88 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cspp1B2RX88 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cspp1B2RX88 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cspp1B2RX88 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cspp1B2RX88 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cspp1B2RX88 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cspp1B2RX88 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cspp1B2RX88 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cspp1B2RX88 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cspp1B2RX88 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cspp1B2RX88 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cspp1B2RX88 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cspp1B2RX88 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cspp1B2RX88 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cspp1B2RX88 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cspp1B2RX88 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cspp1B2RX88 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cspp1B2RX88 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cspp1B2RX88 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cspp1B2RX88 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cspp1B2RX88 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cspp1B2RX88 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cspp1B2RX88 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cspp1B2RX88 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cspp1B2RX88 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cspp1B2RX88 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cspp1B2RX88 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cspp1B2RX88 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cspp1B2RX88 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cspp1B2RX88 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cspp1B2RX88 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cspp1B2RX88 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cspp1B2RX88 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cspp1B2RX88 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cspp1B2RX88 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cspp1B2RX88 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cspp1B2RX88 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Cspp1B2RX88 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cspp1B2RX88 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cspp1B2RX88 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cspp1B2RX88 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cspp1B2RX88 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cspp1B2RX88 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cspp1B2RX88 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cspp1B2RX88 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cspp1B2RX88 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cspp1B2RX88 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cspp1B2RX88 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cspp1B2RX88 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cspp1B2RX88 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cspp1B2RX88 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cspp1B2RX88 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cspp1B2RX88 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cspp1B2RX88 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cspp1B2RX88 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cspp1B2RX88 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cspp1B2RX88 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cspp1B2RX88 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cspp1B2RX88 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cspp1B2RX88 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cspp1B2RX88 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cspp1B2RX88 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cspp1B2RX88 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cspp1B2RX88 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cspp1B2RX88 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cspp1B2RX88 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cspp1B2RX88 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cspp1B2RX88 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cspp1B2RX88 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cspp1B2RX88 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.2 ms