Protein–RNA interactions for Protein: B1AUH1

Ptpru, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpruB1AUH1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PtpruB1AUH1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PtpruB1AUH1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PtpruB1AUH1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PtpruB1AUH1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PtpruB1AUH1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PtpruB1AUH1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PtpruB1AUH1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PtpruB1AUH1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PtpruB1AUH1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PtpruB1AUH1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PtpruB1AUH1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PtpruB1AUH1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PtpruB1AUH1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PtpruB1AUH1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PtpruB1AUH1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PtpruB1AUH1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PtpruB1AUH1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PtpruB1AUH1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PtpruB1AUH1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PtpruB1AUH1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PtpruB1AUH1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PtpruB1AUH1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PtpruB1AUH1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PtpruB1AUH1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PtpruB1AUH1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PtpruB1AUH1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
PtpruB1AUH1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PtpruB1AUH1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PtpruB1AUH1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PtpruB1AUH1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PtpruB1AUH1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PtpruB1AUH1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PtpruB1AUH1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PtpruB1AUH1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PtpruB1AUH1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PtpruB1AUH1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PtpruB1AUH1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
PtpruB1AUH1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PtpruB1AUH1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PtpruB1AUH1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PtpruB1AUH1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PtpruB1AUH1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PtpruB1AUH1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PtpruB1AUH1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PtpruB1AUH1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PtpruB1AUH1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PtpruB1AUH1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PtpruB1AUH1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PtpruB1AUH1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PtpruB1AUH1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PtpruB1AUH1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PtpruB1AUH1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PtpruB1AUH1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PtpruB1AUH1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PtpruB1AUH1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PtpruB1AUH1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PtpruB1AUH1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PtpruB1AUH1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PtpruB1AUH1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PtpruB1AUH1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PtpruB1AUH1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PtpruB1AUH1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
PtpruB1AUH1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PtpruB1AUH1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PtpruB1AUH1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PtpruB1AUH1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PtpruB1AUH1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PtpruB1AUH1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PtpruB1AUH1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PtpruB1AUH1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PtpruB1AUH1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PtpruB1AUH1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PtpruB1AUH1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PtpruB1AUH1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PtpruB1AUH1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PtpruB1AUH1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PtpruB1AUH1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PtpruB1AUH1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PtpruB1AUH1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
PtpruB1AUH1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
PtpruB1AUH1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PtpruB1AUH1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PtpruB1AUH1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PtpruB1AUH1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PtpruB1AUH1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PtpruB1AUH1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PtpruB1AUH1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
PtpruB1AUH1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
PtpruB1AUH1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PtpruB1AUH1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PtpruB1AUH1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PtpruB1AUH1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PtpruB1AUH1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PtpruB1AUH1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PtpruB1AUH1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PtpruB1AUH1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PtpruB1AUH1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PtpruB1AUH1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PtpruB1AUH1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms