Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trabd2bB1ATG9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trabd2bB1ATG9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trabd2bB1ATG9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trabd2bB1ATG9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trabd2bB1ATG9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trabd2bB1ATG9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trabd2bB1ATG9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trabd2bB1ATG9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trabd2bB1ATG9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trabd2bB1ATG9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trabd2bB1ATG9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trabd2bB1ATG9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trabd2bB1ATG9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trabd2bB1ATG9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trabd2bB1ATG9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trabd2bB1ATG9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trabd2bB1ATG9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trabd2bB1ATG9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trabd2bB1ATG9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trabd2bB1ATG9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trabd2bB1ATG9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trabd2bB1ATG9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trabd2bB1ATG9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trabd2bB1ATG9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trabd2bB1ATG9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trabd2bB1ATG9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trabd2bB1ATG9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trabd2bB1ATG9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trabd2bB1ATG9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trabd2bB1ATG9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trabd2bB1ATG9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trabd2bB1ATG9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trabd2bB1ATG9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Trabd2bB1ATG9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trabd2bB1ATG9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trabd2bB1ATG9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trabd2bB1ATG9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trabd2bB1ATG9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trabd2bB1ATG9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trabd2bB1ATG9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trabd2bB1ATG9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trabd2bB1ATG9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trabd2bB1ATG9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trabd2bB1ATG9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trabd2bB1ATG9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trabd2bB1ATG9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trabd2bB1ATG9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trabd2bB1ATG9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trabd2bB1ATG9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trabd2bB1ATG9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Trabd2bB1ATG9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trabd2bB1ATG9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trabd2bB1ATG9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trabd2bB1ATG9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trabd2bB1ATG9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trabd2bB1ATG9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trabd2bB1ATG9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trabd2bB1ATG9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trabd2bB1ATG9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trabd2bB1ATG9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trabd2bB1ATG9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trabd2bB1ATG9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trabd2bB1ATG9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trabd2bB1ATG9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trabd2bB1ATG9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trabd2bB1ATG9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trabd2bB1ATG9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trabd2bB1ATG9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trabd2bB1ATG9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trabd2bB1ATG9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trabd2bB1ATG9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trabd2bB1ATG9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trabd2bB1ATG9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trabd2bB1ATG9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trabd2bB1ATG9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trabd2bB1ATG9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trabd2bB1ATG9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trabd2bB1ATG9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trabd2bB1ATG9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trabd2bB1ATG9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trabd2bB1ATG9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trabd2bB1ATG9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trabd2bB1ATG9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trabd2bB1ATG9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trabd2bB1ATG9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trabd2bB1ATG9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trabd2bB1ATG9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trabd2bB1ATG9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Trabd2bB1ATG9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trabd2bB1ATG9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trabd2bB1ATG9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trabd2bB1ATG9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trabd2bB1ATG9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trabd2bB1ATG9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trabd2bB1ATG9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trabd2bB1ATG9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trabd2bB1ATG9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trabd2bB1ATG9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trabd2bB1ATG9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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