Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Frmpd4A2AFR3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Frmpd4A2AFR3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Frmpd4A2AFR3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Frmpd4A2AFR3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Frmpd4A2AFR3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Frmpd4A2AFR3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Frmpd4A2AFR3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Frmpd4A2AFR3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Frmpd4A2AFR3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Frmpd4A2AFR3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Frmpd4A2AFR3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Frmpd4A2AFR3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Frmpd4A2AFR3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Frmpd4A2AFR3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Frmpd4A2AFR3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Frmpd4A2AFR3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Frmpd4A2AFR3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Frmpd4A2AFR3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Frmpd4A2AFR3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Frmpd4A2AFR3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Frmpd4A2AFR3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Frmpd4A2AFR3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Frmpd4A2AFR3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Frmpd4A2AFR3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Frmpd4A2AFR3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Frmpd4A2AFR3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Frmpd4A2AFR3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Frmpd4A2AFR3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Frmpd4A2AFR3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Frmpd4A2AFR3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Frmpd4A2AFR3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Frmpd4A2AFR3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Frmpd4A2AFR3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Frmpd4A2AFR3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Frmpd4A2AFR3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Frmpd4A2AFR3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Frmpd4A2AFR3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Frmpd4A2AFR3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Frmpd4A2AFR3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Frmpd4A2AFR3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Frmpd4A2AFR3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Frmpd4A2AFR3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Frmpd4A2AFR3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Frmpd4A2AFR3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Frmpd4A2AFR3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Frmpd4A2AFR3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Frmpd4A2AFR3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Frmpd4A2AFR3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Frmpd4A2AFR3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Frmpd4A2AFR3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Frmpd4A2AFR3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Frmpd4A2AFR3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Frmpd4A2AFR3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Frmpd4A2AFR3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Frmpd4A2AFR3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Frmpd4A2AFR3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Frmpd4A2AFR3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Frmpd4A2AFR3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Frmpd4A2AFR3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Frmpd4A2AFR3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Frmpd4A2AFR3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Frmpd4A2AFR3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Frmpd4A2AFR3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Frmpd4A2AFR3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Frmpd4A2AFR3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Frmpd4A2AFR3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Frmpd4A2AFR3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Frmpd4A2AFR3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Frmpd4A2AFR3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Frmpd4A2AFR3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Frmpd4A2AFR3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Frmpd4A2AFR3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Frmpd4A2AFR3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Frmpd4A2AFR3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Frmpd4A2AFR3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Frmpd4A2AFR3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Frmpd4A2AFR3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Frmpd4A2AFR3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Frmpd4A2AFR3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Frmpd4A2AFR3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Frmpd4A2AFR3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Frmpd4A2AFR3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Frmpd4A2AFR3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Frmpd4A2AFR3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Frmpd4A2AFR3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Frmpd4A2AFR3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Frmpd4A2AFR3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Frmpd4A2AFR3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Frmpd4A2AFR3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Frmpd4A2AFR3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Frmpd4A2AFR3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Frmpd4A2AFR3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Frmpd4A2AFR3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Frmpd4A2AFR3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Frmpd4A2AFR3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Frmpd4A2AFR3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Frmpd4A2AFR3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Frmpd4A2AFR3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Frmpd4A2AFR3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms