Protein–RNA interactions for Protein: A2ACP1

Ttc39a, Tetratricopeptide repeat protein 39A, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39aA2ACP1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc39aA2ACP1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc39aA2ACP1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc39aA2ACP1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc39aA2ACP1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc39aA2ACP1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc39aA2ACP1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc39aA2ACP1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc39aA2ACP1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc39aA2ACP1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc39aA2ACP1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc39aA2ACP1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ttc39aA2ACP1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc39aA2ACP1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc39aA2ACP1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc39aA2ACP1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc39aA2ACP1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc39aA2ACP1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc39aA2ACP1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc39aA2ACP1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc39aA2ACP1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc39aA2ACP1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc39aA2ACP1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc39aA2ACP1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc39aA2ACP1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc39aA2ACP1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc39aA2ACP1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc39aA2ACP1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc39aA2ACP1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc39aA2ACP1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc39aA2ACP1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc39aA2ACP1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc39aA2ACP1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc39aA2ACP1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc39aA2ACP1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc39aA2ACP1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc39aA2ACP1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc39aA2ACP1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc39aA2ACP1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc39aA2ACP1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc39aA2ACP1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc39aA2ACP1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc39aA2ACP1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc39aA2ACP1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc39aA2ACP1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc39aA2ACP1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc39aA2ACP1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ttc39aA2ACP1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttc39aA2ACP1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttc39aA2ACP1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttc39aA2ACP1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttc39aA2ACP1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttc39aA2ACP1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttc39aA2ACP1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttc39aA2ACP1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttc39aA2ACP1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc39aA2ACP1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc39aA2ACP1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc39aA2ACP1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc39aA2ACP1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc39aA2ACP1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc39aA2ACP1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc39aA2ACP1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc39aA2ACP1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc39aA2ACP1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc39aA2ACP1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc39aA2ACP1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc39aA2ACP1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc39aA2ACP1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc39aA2ACP1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc39aA2ACP1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc39aA2ACP1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc39aA2ACP1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc39aA2ACP1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc39aA2ACP1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc39aA2ACP1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc39aA2ACP1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc39aA2ACP1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttc39aA2ACP1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Ttc39aA2ACP1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ttc39aA2ACP1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttc39aA2ACP1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttc39aA2ACP1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttc39aA2ACP1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttc39aA2ACP1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttc39aA2ACP1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc39aA2ACP1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc39aA2ACP1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ttc39aA2ACP1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc39aA2ACP1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc39aA2ACP1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc39aA2ACP1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc39aA2ACP1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc39aA2ACP1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc39aA2ACP1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc39aA2ACP1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc39aA2ACP1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc39aA2ACP1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc39aA2ACP1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc39aA2ACP1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms