Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rbbp8nlA2ABX0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rbbp8nlA2ABX0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rbbp8nlA2ABX0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rbbp8nlA2ABX0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rbbp8nlA2ABX0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rbbp8nlA2ABX0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rbbp8nlA2ABX0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rbbp8nlA2ABX0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rbbp8nlA2ABX0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rbbp8nlA2ABX0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Rbbp8nlA2ABX0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rbbp8nlA2ABX0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rbbp8nlA2ABX0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rbbp8nlA2ABX0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rbbp8nlA2ABX0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rbbp8nlA2ABX0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rbbp8nlA2ABX0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rbbp8nlA2ABX0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rbbp8nlA2ABX0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rbbp8nlA2ABX0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rbbp8nlA2ABX0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Rbbp8nlA2ABX0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rbbp8nlA2ABX0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rbbp8nlA2ABX0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rbbp8nlA2ABX0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rbbp8nlA2ABX0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rbbp8nlA2ABX0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rbbp8nlA2ABX0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rbbp8nlA2ABX0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rbbp8nlA2ABX0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rbbp8nlA2ABX0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rbbp8nlA2ABX0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rbbp8nlA2ABX0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rbbp8nlA2ABX0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rbbp8nlA2ABX0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rbbp8nlA2ABX0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rbbp8nlA2ABX0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rbbp8nlA2ABX0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rbbp8nlA2ABX0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rbbp8nlA2ABX0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rbbp8nlA2ABX0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rbbp8nlA2ABX0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rbbp8nlA2ABX0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rbbp8nlA2ABX0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rbbp8nlA2ABX0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rbbp8nlA2ABX0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rbbp8nlA2ABX0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rbbp8nlA2ABX0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rbbp8nlA2ABX0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Rbbp8nlA2ABX0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rbbp8nlA2ABX0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rbbp8nlA2ABX0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rbbp8nlA2ABX0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rbbp8nlA2ABX0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rbbp8nlA2ABX0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rbbp8nlA2ABX0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rbbp8nlA2ABX0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rbbp8nlA2ABX0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rbbp8nlA2ABX0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rbbp8nlA2ABX0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rbbp8nlA2ABX0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rbbp8nlA2ABX0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rbbp8nlA2ABX0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rbbp8nlA2ABX0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rbbp8nlA2ABX0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rbbp8nlA2ABX0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rbbp8nlA2ABX0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rbbp8nlA2ABX0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rbbp8nlA2ABX0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rbbp8nlA2ABX0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rbbp8nlA2ABX0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rbbp8nlA2ABX0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rbbp8nlA2ABX0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rbbp8nlA2ABX0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rbbp8nlA2ABX0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rbbp8nlA2ABX0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rbbp8nlA2ABX0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rbbp8nlA2ABX0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rbbp8nlA2ABX0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rbbp8nlA2ABX0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rbbp8nlA2ABX0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rbbp8nlA2ABX0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rbbp8nlA2ABX0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rbbp8nlA2ABX0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rbbp8nlA2ABX0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rbbp8nlA2ABX0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rbbp8nlA2ABX0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rbbp8nlA2ABX0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rbbp8nlA2ABX0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rbbp8nlA2ABX0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rbbp8nlA2ABX0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rbbp8nlA2ABX0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rbbp8nlA2ABX0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rbbp8nlA2ABX0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rbbp8nlA2ABX0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms