Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L1

Chd5, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd5A2A8L1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Chd5A2A8L1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Chd5A2A8L1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Chd5A2A8L1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Chd5A2A8L1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Chd5A2A8L1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Chd5A2A8L1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Chd5A2A8L1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Chd5A2A8L1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Chd5A2A8L1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Chd5A2A8L1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Chd5A2A8L1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Chd5A2A8L1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Chd5A2A8L1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Chd5A2A8L1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Chd5A2A8L1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Chd5A2A8L1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Chd5A2A8L1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Chd5A2A8L1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Chd5A2A8L1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Chd5A2A8L1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Chd5A2A8L1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Chd5A2A8L1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Chd5A2A8L1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Chd5A2A8L1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Chd5A2A8L1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Chd5A2A8L1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Chd5A2A8L1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Chd5A2A8L1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Chd5A2A8L1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Chd5A2A8L1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Chd5A2A8L1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Chd5A2A8L1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Chd5A2A8L1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Chd5A2A8L1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Chd5A2A8L1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Chd5A2A8L1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Chd5A2A8L1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chd5A2A8L1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chd5A2A8L1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chd5A2A8L1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chd5A2A8L1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chd5A2A8L1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Chd5A2A8L1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Chd5A2A8L1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Chd5A2A8L1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Chd5A2A8L1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Chd5A2A8L1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Chd5A2A8L1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Chd5A2A8L1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Chd5A2A8L1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Chd5A2A8L1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Chd5A2A8L1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Chd5A2A8L1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Chd5A2A8L1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Chd5A2A8L1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Chd5A2A8L1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Chd5A2A8L1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Chd5A2A8L1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Chd5A2A8L1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Chd5A2A8L1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Chd5A2A8L1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Chd5A2A8L1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chd5A2A8L1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chd5A2A8L1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chd5A2A8L1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chd5A2A8L1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Chd5A2A8L1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chd5A2A8L1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chd5A2A8L1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Chd5A2A8L1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Chd5A2A8L1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Chd5A2A8L1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Chd5A2A8L1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Chd5A2A8L1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Chd5A2A8L1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Chd5A2A8L1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Chd5A2A8L1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Chd5A2A8L1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chd5A2A8L1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chd5A2A8L1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chd5A2A8L1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chd5A2A8L1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chd5A2A8L1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chd5A2A8L1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Chd5A2A8L1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Chd5A2A8L1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Chd5A2A8L1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Chd5A2A8L1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Chd5A2A8L1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Chd5A2A8L1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Chd5A2A8L1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Chd5A2A8L1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Chd5A2A8L1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Chd5A2A8L1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Chd5A2A8L1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Chd5A2A8L1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Chd5A2A8L1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Chd5A2A8L1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Chd5A2A8L1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms