Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Calcoco2A2A6M5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Calcoco2A2A6M5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Calcoco2A2A6M5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Calcoco2A2A6M5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Calcoco2A2A6M5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Calcoco2A2A6M5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Calcoco2A2A6M5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Calcoco2A2A6M5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Calcoco2A2A6M5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Calcoco2A2A6M5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Calcoco2A2A6M5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Calcoco2A2A6M5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Calcoco2A2A6M5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Calcoco2A2A6M5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Calcoco2A2A6M5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Calcoco2A2A6M5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Calcoco2A2A6M5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Calcoco2A2A6M5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Calcoco2A2A6M5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Calcoco2A2A6M5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Calcoco2A2A6M5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Calcoco2A2A6M5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Calcoco2A2A6M5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Calcoco2A2A6M5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Calcoco2A2A6M5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Calcoco2A2A6M5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Calcoco2A2A6M5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Calcoco2A2A6M5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Calcoco2A2A6M5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Calcoco2A2A6M5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Calcoco2A2A6M5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Calcoco2A2A6M5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Calcoco2A2A6M5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Calcoco2A2A6M5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Calcoco2A2A6M5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Calcoco2A2A6M5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Calcoco2A2A6M5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Calcoco2A2A6M5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Calcoco2A2A6M5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Calcoco2A2A6M5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Calcoco2A2A6M5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Calcoco2A2A6M5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Calcoco2A2A6M5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Calcoco2A2A6M5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Calcoco2A2A6M5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Calcoco2A2A6M5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Calcoco2A2A6M5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Calcoco2A2A6M5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Calcoco2A2A6M5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Calcoco2A2A6M5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Calcoco2A2A6M5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Calcoco2A2A6M5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Calcoco2A2A6M5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Calcoco2A2A6M5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Calcoco2A2A6M5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Calcoco2A2A6M5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Calcoco2A2A6M5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Calcoco2A2A6M5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Calcoco2A2A6M5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Calcoco2A2A6M5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Calcoco2A2A6M5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Calcoco2A2A6M5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Calcoco2A2A6M5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Calcoco2A2A6M5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Calcoco2A2A6M5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Calcoco2A2A6M5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Calcoco2A2A6M5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Calcoco2A2A6M5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Calcoco2A2A6M5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Calcoco2A2A6M5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Calcoco2A2A6M5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Calcoco2A2A6M5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Calcoco2A2A6M5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Calcoco2A2A6M5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Calcoco2A2A6M5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Calcoco2A2A6M5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Calcoco2A2A6M5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Calcoco2A2A6M5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Calcoco2A2A6M5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Calcoco2A2A6M5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Calcoco2A2A6M5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Calcoco2A2A6M5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Calcoco2A2A6M5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Calcoco2A2A6M5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Calcoco2A2A6M5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Calcoco2A2A6M5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Calcoco2A2A6M5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Calcoco2A2A6M5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Calcoco2A2A6M5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Calcoco2A2A6M5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Calcoco2A2A6M5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Calcoco2A2A6M5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Calcoco2A2A6M5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Calcoco2A2A6M5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Calcoco2A2A6M5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Calcoco2A2A6M5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Calcoco2A2A6M5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Calcoco2A2A6M5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Calcoco2A2A6M5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms