Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Top3bQ9Z321 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Top3bQ9Z321 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Top3bQ9Z321 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms