Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms