Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms