Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
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Hdac5Q9Z2V6 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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Hdac5Q9Z2V6 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hdac5Q9Z2V6 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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Hdac5Q9Z2V6 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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Hdac5Q9Z2V6 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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Hdac5Q9Z2V6 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hdac5Q9Z2V6 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hdac5Q9Z2V6 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hdac5Q9Z2V6 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hdac5Q9Z2V6 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hdac5Q9Z2V6 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hdac5Q9Z2V6 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hdac5Q9Z2V6 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hdac5Q9Z2V6 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hdac5Q9Z2V6 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hdac5Q9Z2V6 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hdac5Q9Z2V6 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hdac5Q9Z2V6 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hdac5Q9Z2V6 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hdac5Q9Z2V6 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hdac5Q9Z2V6 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hdac5Q9Z2V6 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
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