Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

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Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Hdac6Q9Z2V5 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Hdac6Q9Z2V5 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Hdac6Q9Z2V5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Hdac6Q9Z2V5 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Hdac6Q9Z2V5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Hdac6Q9Z2V5 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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Hdac6Q9Z2V5 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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Hdac6Q9Z2V5 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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