Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms