Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms