Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms