Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ap3b1Q9Z1T1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms