Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z121

Ccl8, C-C motif chemokine 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl8Q9Z121 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl8Q9Z121 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl8Q9Z121 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl8Q9Z121 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl8Q9Z121 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl8Q9Z121 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl8Q9Z121 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl8Q9Z121 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl8Q9Z121 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl8Q9Z121 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl8Q9Z121 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl8Q9Z121 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl8Q9Z121 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl8Q9Z121 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl8Q9Z121 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl8Q9Z121 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl8Q9Z121 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl8Q9Z121 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl8Q9Z121 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl8Q9Z121 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl8Q9Z121 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl8Q9Z121 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl8Q9Z121 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl8Q9Z121 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl8Q9Z121 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl8Q9Z121 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl8Q9Z121 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl8Q9Z121 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl8Q9Z121 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl8Q9Z121 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl8Q9Z121 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl8Q9Z121 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl8Q9Z121 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl8Q9Z121 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl8Q9Z121 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl8Q9Z121 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl8Q9Z121 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl8Q9Z121 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl8Q9Z121 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl8Q9Z121 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl8Q9Z121 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl8Q9Z121 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl8Q9Z121 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl8Q9Z121 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl8Q9Z121 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl8Q9Z121 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl8Q9Z121 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl8Q9Z121 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl8Q9Z121 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl8Q9Z121 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl8Q9Z121 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl8Q9Z121 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl8Q9Z121 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl8Q9Z121 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl8Q9Z121 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl8Q9Z121 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl8Q9Z121 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl8Q9Z121 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl8Q9Z121 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ccl8Q9Z121 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ccl8Q9Z121 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl8Q9Z121 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl8Q9Z121 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl8Q9Z121 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl8Q9Z121 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl8Q9Z121 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl8Q9Z121 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl8Q9Z121 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl8Q9Z121 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl8Q9Z121 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl8Q9Z121 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl8Q9Z121 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl8Q9Z121 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl8Q9Z121 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl8Q9Z121 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl8Q9Z121 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl8Q9Z121 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl8Q9Z121 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl8Q9Z121 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl8Q9Z121 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl8Q9Z121 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl8Q9Z121 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl8Q9Z121 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl8Q9Z121 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl8Q9Z121 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl8Q9Z121 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl8Q9Z121 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl8Q9Z121 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl8Q9Z121 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl8Q9Z121 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl8Q9Z121 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl8Q9Z121 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl8Q9Z121 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl8Q9Z121 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl8Q9Z121 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl8Q9Z121 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl8Q9Z121 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl8Q9Z121 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl8Q9Z121 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl8Q9Z121 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms