Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms