Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clip2Q9Z0H8 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clip2Q9Z0H8 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clip2Q9Z0H8 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clip2Q9Z0H8 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clip2Q9Z0H8 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clip2Q9Z0H8 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clip2Q9Z0H8 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clip2Q9Z0H8 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clip2Q9Z0H8 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clip2Q9Z0H8 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clip2Q9Z0H8 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clip2Q9Z0H8 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clip2Q9Z0H8 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clip2Q9Z0H8 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clip2Q9Z0H8 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clip2Q9Z0H8 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Clip2Q9Z0H8 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clip2Q9Z0H8 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clip2Q9Z0H8 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Clip2Q9Z0H8 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clip2Q9Z0H8 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Clip2Q9Z0H8 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clip2Q9Z0H8 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clip2Q9Z0H8 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clip2Q9Z0H8 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Clip2Q9Z0H8 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clip2Q9Z0H8 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clip2Q9Z0H8 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clip2Q9Z0H8 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clip2Q9Z0H8 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clip2Q9Z0H8 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clip2Q9Z0H8 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clip2Q9Z0H8 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clip2Q9Z0H8 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clip2Q9Z0H8 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clip2Q9Z0H8 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clip2Q9Z0H8 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Clip2Q9Z0H8 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clip2Q9Z0H8 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clip2Q9Z0H8 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clip2Q9Z0H8 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clip2Q9Z0H8 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clip2Q9Z0H8 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clip2Q9Z0H8 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clip2Q9Z0H8 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clip2Q9Z0H8 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clip2Q9Z0H8 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clip2Q9Z0H8 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clip2Q9Z0H8 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clip2Q9Z0H8 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clip2Q9Z0H8 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clip2Q9Z0H8 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clip2Q9Z0H8 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clip2Q9Z0H8 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clip2Q9Z0H8 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clip2Q9Z0H8 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clip2Q9Z0H8 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clip2Q9Z0H8 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clip2Q9Z0H8 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clip2Q9Z0H8 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clip2Q9Z0H8 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clip2Q9Z0H8 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clip2Q9Z0H8 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clip2Q9Z0H8 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clip2Q9Z0H8 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clip2Q9Z0H8 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clip2Q9Z0H8 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clip2Q9Z0H8 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clip2Q9Z0H8 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clip2Q9Z0H8 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clip2Q9Z0H8 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clip2Q9Z0H8 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clip2Q9Z0H8 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Clip2Q9Z0H8 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clip2Q9Z0H8 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clip2Q9Z0H8 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Clip2Q9Z0H8 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Clip2Q9Z0H8 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clip2Q9Z0H8 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clip2Q9Z0H8 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clip2Q9Z0H8 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Clip2Q9Z0H8 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clip2Q9Z0H8 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clip2Q9Z0H8 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clip2Q9Z0H8 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clip2Q9Z0H8 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clip2Q9Z0H8 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clip2Q9Z0H8 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clip2Q9Z0H8 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clip2Q9Z0H8 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clip2Q9Z0H8 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clip2Q9Z0H8 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clip2Q9Z0H8 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clip2Q9Z0H8 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clip2Q9Z0H8 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clip2Q9Z0H8 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clip2Q9Z0H8 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clip2Q9Z0H8 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clip2Q9Z0H8 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms