Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVP6

Papolb, Poly(A) polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolbQ9WVP6 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.04■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PapolbQ9WVP6 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms