Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0C8

Vav3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav3Q9R0C8 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vav3Q9R0C8 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vav3Q9R0C8 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vav3Q9R0C8 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vav3Q9R0C8 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vav3Q9R0C8 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vav3Q9R0C8 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vav3Q9R0C8 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vav3Q9R0C8 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vav3Q9R0C8 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vav3Q9R0C8 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vav3Q9R0C8 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vav3Q9R0C8 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vav3Q9R0C8 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vav3Q9R0C8 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vav3Q9R0C8 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vav3Q9R0C8 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vav3Q9R0C8 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vav3Q9R0C8 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vav3Q9R0C8 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vav3Q9R0C8 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vav3Q9R0C8 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vav3Q9R0C8 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Vav3Q9R0C8 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vav3Q9R0C8 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Vav3Q9R0C8 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vav3Q9R0C8 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vav3Q9R0C8 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vav3Q9R0C8 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vav3Q9R0C8 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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