Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms