Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

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Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Nek3Q9R0A5 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Nek3Q9R0A5 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
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Nek3Q9R0A5 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Nek3Q9R0A5 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Nek3Q9R0A5 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms