Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Gpc6Q9R087 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Gpc6Q9R087 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Gpc6Q9R087 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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