Protein–RNA interactions for Protein: Q9R059

Fhl3, Four and a half LIM domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhl3Q9R059 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Fhl3Q9R059 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms