Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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