Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms