Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms