Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY80

Hacd1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd1Q9QY80 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hacd1Q9QY80 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Hacd1Q9QY80 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hacd1Q9QY80 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Hacd1Q9QY80 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hacd1Q9QY80 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hacd1Q9QY80 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hacd1Q9QY80 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hacd1Q9QY80 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hacd1Q9QY80 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hacd1Q9QY80 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hacd1Q9QY80 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hacd1Q9QY80 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hacd1Q9QY80 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hacd1Q9QY80 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hacd1Q9QY80 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hacd1Q9QY80 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Hacd1Q9QY80 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hacd1Q9QY80 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hacd1Q9QY80 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hacd1Q9QY80 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hacd1Q9QY80 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Hacd1Q9QY80 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hacd1Q9QY80 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hacd1Q9QY80 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hacd1Q9QY80 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hacd1Q9QY80 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms