Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms