Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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