Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Tgm1Q9JLF6 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Tgm1Q9JLF6 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Tgm1Q9JLF6 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Tgm1Q9JLF6 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Tgm1Q9JLF6 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Tgm1Q9JLF6 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Tgm1Q9JLF6 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Tgm1Q9JLF6 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Tgm1Q9JLF6 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Tgm1Q9JLF6 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms