Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

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Length 549 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nectin3Q9JLB9 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms