Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms