Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms