Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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Trim39Q9ESN2 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Trim39Q9ESN2 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Trim39Q9ESN2 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Trim39Q9ESN2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Trim39Q9ESN2 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
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