Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD7

Dysf, Dysferlin, mousemouse

Predictions only

Length 2,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DysfQ9ESD7 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DysfQ9ESD7 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms