Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ush1cQ9ES64 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms