Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tlr1Q9EPQ1 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tlr1Q9EPQ1 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tlr1Q9EPQ1 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tlr1Q9EPQ1 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tlr1Q9EPQ1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tlr1Q9EPQ1 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Tlr1Q9EPQ1 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tlr1Q9EPQ1 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tlr1Q9EPQ1 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tlr1Q9EPQ1 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tlr1Q9EPQ1 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tlr1Q9EPQ1 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tlr1Q9EPQ1 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tlr1Q9EPQ1 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tlr1Q9EPQ1 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tlr1Q9EPQ1 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tlr1Q9EPQ1 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tlr1Q9EPQ1 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tlr1Q9EPQ1 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tlr1Q9EPQ1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tlr1Q9EPQ1 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tlr1Q9EPQ1 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tlr1Q9EPQ1 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tlr1Q9EPQ1 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tlr1Q9EPQ1 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tlr1Q9EPQ1 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tlr1Q9EPQ1 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tlr1Q9EPQ1 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tlr1Q9EPQ1 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tlr1Q9EPQ1 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tlr1Q9EPQ1 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tlr1Q9EPQ1 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tlr1Q9EPQ1 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tlr1Q9EPQ1 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tlr1Q9EPQ1 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tlr1Q9EPQ1 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Tlr1Q9EPQ1 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tlr1Q9EPQ1 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Tlr1Q9EPQ1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Tlr1Q9EPQ1 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tlr1Q9EPQ1 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Tlr1Q9EPQ1 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tlr1Q9EPQ1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Tlr1Q9EPQ1 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Tlr1Q9EPQ1 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Tlr1Q9EPQ1 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Tlr1Q9EPQ1 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Tlr1Q9EPQ1 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tlr1Q9EPQ1 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tlr1Q9EPQ1 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tlr1Q9EPQ1 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Tlr1Q9EPQ1 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tlr1Q9EPQ1 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tlr1Q9EPQ1 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Tlr1Q9EPQ1 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tlr1Q9EPQ1 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Tlr1Q9EPQ1 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tlr1Q9EPQ1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tlr1Q9EPQ1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tlr1Q9EPQ1 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tlr1Q9EPQ1 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tlr1Q9EPQ1 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tlr1Q9EPQ1 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tlr1Q9EPQ1 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tlr1Q9EPQ1 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tlr1Q9EPQ1 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tlr1Q9EPQ1 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tlr1Q9EPQ1 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tlr1Q9EPQ1 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tlr1Q9EPQ1 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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