Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms