Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms